BlastExtendRepraze

http://www.tigr.org/edutrain/training/annotation_engine.shtml

[TIGR]사에서 미생물 GenomeAnnotation전략시 서열 homology검색에 [BLAST]대신 쓰고자 하는 확장형 프로그램

기존[BLAST]는 만일 [Gene]부위에서 시퀀싱에러에 의한 framshift 발생시 [Gene]을 두개로 인식하는 문제가 있다. 따라서 blastx수행시 앞뒤 얼마정도까지 커버하면서 검색하는 방법을 이용한다.


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