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Large Sequence간의 효율적인 Alignment를 위해 TIGR에서 개발한 프로그램. Large Sequence간의 효율적인 SequenceAlignment를 위해 [TIGR]에서 개발한 프로그램.

Large Sequence간의 효율적인 SequenceAlignment를 위해 [TIGR]에서 개발한 프로그램.

SuffixTree를 이용하여 빠른 속도로 긴 서열을 매칭시키는 것이 특징이다. 5Mbps 정도의 두 서열을 매치시키는데 13초 정도 걸린다고.

http://www.tigr.org/software/mummer/

관련 paper : [http://bioinfo.sarang.net/moin/wiki/upload/MUMmer.pdf]


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MUMmer (last edited 2013-08-24 15:28:34 by 211)

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